Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RykQ01887 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RykQ01887 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RykQ01887 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RykQ01887 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RykQ01887 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms