Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx2P81066 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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