Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr7P58681 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms