Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnt2P50752 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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