Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpbP50405 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms