Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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