Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms