Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18530 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18530 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18530 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms