Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Spi1P17433 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Spi1P17433 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Spi1P17433 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Spi1P17433 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spi1P17433 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms