Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms