Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP11369 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP11369 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP11369 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP11369 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP11369 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP11369 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP11369 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms