Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LtaP09225 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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