Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms