Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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