Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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