Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Dgcr6O35347 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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