Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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