Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms