Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm379J3QQ19 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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