Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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