Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top6blJ3QMY9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms