Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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