Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms