Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms