Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3002E9PW72 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms