Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms