Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms