Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frmpd4A2AFR3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms