Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myom3A2ABU4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms