Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms