Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms