Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms