Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms