Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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