Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms