Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc2Q9R244 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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