Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms