Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chaf1aQ9QWF0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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