Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms