Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Usp29Q9ES63 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Usp29Q9ES63 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms