Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tlnrd1Q9ERE8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tlnrd1Q9ERE8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tlnrd1Q9ERE8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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