Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms