Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp5Q9D7S9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms