Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms