Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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