Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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