Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms