Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms