Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms