Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid1ip1Q9CQ20 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms